Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms