Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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