Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms