Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms