Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D130052B06RikQ3UW13 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms