Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms