Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zswim8Q3UHH1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zswim8Q3UHH1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms