Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx27Q3UHD6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx27Q3UHD6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx27Q3UHD6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx27Q3UHD6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx27Q3UHD6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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