Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms