Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms