Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zbtb38Q3LR78 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms