Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms