Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCOF1Q13428 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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