Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms