Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr5Q04683 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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