Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnb1Q03717 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms