Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms