Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms