Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms