Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mesp1P97309 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms