Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms