Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tp53bp1P70399 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tp53bp1P70399 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tp53bp1P70399 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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