Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps13P62301 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rps13P62301 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps13P62301 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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