Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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