Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2fP61219 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms