Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms