Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms