Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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