Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms