Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms