Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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