Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VimP20152 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VimP20152 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VimP20152 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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