Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18530 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms