Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18528 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18528 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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