Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna9P09235 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms