Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GzmbP04187 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms