Protein–RNA interactions for Protein: O88533

Ddc, Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdcO88533 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DdcO88533 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DdcO88533 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DdcO88533 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DdcO88533 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DdcO88533 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DdcO88533 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DdcO88533 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DdcO88533 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DdcO88533 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DdcO88533 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.7 ms