Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms