Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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