Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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