Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r34G3XA52 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms