Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms