Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms