Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm17727E9Q4V7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm17727E9Q4V7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17727E9Q4V7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Gm17727E9Q4V7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17727E9Q4V7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17727E9Q4V7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17727E9Q4V7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17727E9Q4V7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17727E9Q4V7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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