Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms