Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms