Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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