Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms