Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprfA2A8L5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms