Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms